Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm29609Q3UU56 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29609Q3UU56 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm29609Q3UU56 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm29609Q3UU56 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29609Q3UU56 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm29609Q3UU56 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm29609Q3UU56 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm29609Q3UU56 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29609Q3UU56 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms