Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms