Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx21Q3UR97 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms