Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms