Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms