Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms