Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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