Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf40Q3U319 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf40Q3U319 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Rnf40Q3U319 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf40Q3U319 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf40Q3U319 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf40Q3U319 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf40Q3U319 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf40Q3U319 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf40Q3U319 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Rnf40Q3U319 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf40Q3U319 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf40Q3U319 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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