Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Otud5Q3U2S4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud5Q3U2S4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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