Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc174Q3U155 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc174Q3U155 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms