Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms