Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms