Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms