Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt2Q3TTY5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms