Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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