Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms