Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca4Q3TKT4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms