Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2afvQ3THW5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms