Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2f1Q3THK3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2f1Q3THK3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms