Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3KNL4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3KNL4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms