Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss1Q33DR2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms