Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Hdgfl1Q2VPR5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl1Q2VPR5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms