Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms