Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm1123Q1RME4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm1123Q1RME4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm1123Q1RME4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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