Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300lgQ1ERP8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300lgQ1ERP8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms