Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms