Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
StumQ0VBF8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms