Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zc3h18Q0P678 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms