Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms