Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc21bQ0HA38 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc21bQ0HA38 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms