Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc7a1Q09143 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms