Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pate4Q09098 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms