Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms