Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnma1Q08460 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnma1Q08460 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms