Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gata4Q08369 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms