Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MestQ07646 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MestQ07646 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MestQ07646 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MestQ07646 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms