Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a2Q07643 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms