Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gdf3Q07104 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf3Q07104 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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