Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms