Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin2Q05A80 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms