Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Thbs3Q05895 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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