Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hspg2Q05793 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms