Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms