Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox12Q04890 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms