Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms