Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col6a1Q04857 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col6a1Q04857 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms