Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcad1Q04692 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms