Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcr5Q04683 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms