Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms