Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RelaQ04207 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms